外部phpを実行するならexec

exec()

返り値や成否を確認するには引数付ける
成功なら$rtnが0、失敗なら1になる。

実行結果の配列は空でステータスは127なら(エラー:コマンドを特定できない)という意味。

exec('mtime', $out, $rtn);
      print_r( $out );
      echo "<br />";
      echo $rtn;

phpを実行するなら

/usr/bin/php hogehoge.php

のようにphpを指定すること。